Las ventanas ostentan vitrales alusivos a los Misterios Gozosos asociados al rezo y meditaciones del Santo Rosario en el ritual católico. Las piezas ilustran e identifican momentos de la vida de Jesús y María.
Cada vidriera incluye un emblema único. Puede observarse el escudo de Puerto Rico, el lema “la Congregación de la Misión” de los frailes paúles, el escudo de la orden de los frailes dominicos y los varios escudos de los reinos de España.
Los vitrales fueron realizados en los 1920’s por la Casa Mauméjean, de Madrid, que estampó su firma en la parte inferior de dos vidrieras. Para la restauración de San José se repararon e instalaron en un sistema de hierro operable que facilita su mantenimiento y remoción cuando amerite.